Храбри нинџа је стекао много непријатеља због свог интегритета и бескомпромисног односа према свему што наноси штету недужним људима. У игри Нињас Ретурн упознаћете хероја у једном од најмрачнијих дана у његовом животу. Вратио се кући, али је уместо радосног сусрета са породицом био сведок како је његов непријатељ, Црни нинџа, отео његову жену и одвео га у непознатом правцу. Херој одмах креће у потеру, али непријатељ је спреман, покушаће да заустави хероја уз помоћ својих слуге и шумских чудовишта у Нињас Ретурн.
