Инвазија ванземаљаца у Анималс вс Зомбиес изазвала је појаву зомбија. Незвани гости из свемира донели су са собом вирус који људе претвара у живе мртве. Ситуација се погоршавала све док се није догодио чудан догађај. Почело је тако што је група зомбија под контролом ванземаљаца напала кућу фармера. Његов дворски пас стао је у одбрану власника и одједном су се зомбији повукли. Испоставило се да кућни љубимци представљају претњу за зомбије, па чак и ванземаљце, и почели су да хватају животиње и затварају их у кавезе. У игри Животиње против зомбија помоћи ћете хероју да ослободи свог љубимца и бори се против зомбија и ванземаљаца.
