Храбри нинџа по имену Кјото мора да се попне на кров високе зграде. Ви у игри Ниња Уп помоћи ћете лику у овој авантури. Испред вас, ваш нинџа који стоји на земљи биће видљив на екрану. На сигнал, ваш лик ће почети да скаче на одређену висину. Мораћете да нацртате линију испод нинџе помоћу миша. Чим га нацртате, појавиће се посебан гумени конопац. Ваш херој, након што је пао на њега, скочиће и полетети горе. Дакле, повлачењем ових ужади у игри Ниња Уп, постепено ћете помоћи хероју да се попне на кров зграде. Истовремено, успут ћете морати да помогнете нинџи да прикупи предмете који ће висити у ваздуху на разним местима на игралишту. За њихов избор у игри Ниња Уп ће вам дати бодове.