Марио, водоинсталатер којег сви волимо, заинтересовао се за улични спорт као што је паркур. Наш јунак је одлучио да се тренира у овом спорту на крововима градских зграда. Ви у Супер Марио Цити Рун-у ћете му се придружити у овом тренингу. Испред вас на екрану ћете видети Марија како стоји на крову куће. Под вашим вођством, он ће трчати напред постепено повећавајући брзину. Пажљиво погледајте екран. На путу вашег хероја биће неуспеха који раздвајају кровове зграда. Када дотрча до једног од њих на одређеној удаљености, мораћете да га натерате да скочи. Тако ће ваш херој прескочити ову опасност. Такође, пред Мариом ће се појавити препреке. На некима од њих ће моћи да се пење у трци, испод других, напротив, мораће да вози на леђима испод дна. На путу, Марио мора покупити разне предмете који ће вам донети бодове и могу дати хероју разне врсте бонуса.
