Кадета Вилијамса је генерал Муд директно задужио у команди трупа: Инвазија слузи да брани блокаду на путу. Очекује се напад ванземаљаца, чија се инвазија догодила дан раније. Након што сте саслушали кратка упутства, морате прећи на акцију. Кадет има на располагању мали одред и комплет опреме. Можете га изабрати на дну екрана. Одред ће деловати без вашег учешћа, попут тенкова и топова, а ви можете контролисати кадета пуцањем и кретањем. Трооп Цоммандер: Слиме Инвасион је сличан одбрамбеним кулама, али са значајним додатком - можете контролисати главног лика.
