У другом делу Ниња Догс 2, наставићете да помажете одреду нинџа паса у борби против чувара из краљевства мачака. Данас морате напасти њихове дворце, заробити их или уништити. Испред себе на екрану ћете видети одређено подручје у којем ће се зграде налазити. Унутар зграда видећете војничке мачке. На одређеној удаљености од зграда биће постављен топ. Уз његову помоћ, упуцаћете своје ратне псе и они ће, прелетевши одређену удаљеност, ударити у зид зграде и уништити њене мачке у нападу. Да бисте то урадили, мораћете да израчунате путање својих снимака. Након што уништите све мачке, добићете поене и прећи ћете на следећи ниво игре.