Обично је свет игре лојалан свима који желе да науче да лете и покушају се у летењу. Али у Флаппи Аннихилатион 2, све ће бити потпуно супротно. Направили сте специјални уништавач који је дизајниран да не пропусти ниједно летеће створење. Две моћне колоне, једна на дну, а друга на врху, када додирнете екран, конвергирају се и повезују са моћним звуком. Све што се нађе између њих претвара се у проклети комадић. Ваш задатак је да рециклирате све пилиће који су се замислили као летеће птице. Ово ће им бити последњи лет. Ако пропустите три пилића, игра ће се завршити и ваши бодови у Флаппи Аннихилатион 2 памтиће се заувек.
