У малом затвореном граду на југу Америке живели су научници који су спроводили експерименте са биолошким оружјем. Једном се најопаснији вирус ослободио и уништи читаво становништво града. Након смрти, покојници су устали као живи мртви. У игри Цоммандер Сецрет Миссионс послужићете у одреду специјалних снага, којем је наређено да очистите град од зомбија. Пред собом ћете на екрану видети свог лика који ће, са оружјем у рукама, ходати градским улицама. Погледајте пажљиво око себе. Зомбији ће вас напасти са свих страна. Мораћете да задржите раздаљину да бисте их ухватили пред очима вашег оружја и отворили ватру да бисте га убили. Меци који нападају зомбије ће их оштетити. За сваког убијеног зомбија, добићете бодове.
