У савременом свету постоји доста смртоносних вируса који узрокују смрт разним живим бићима. Данас ћете се у Килл Тхе Мицробес борити против неких њихових врста. Пре него што изађете на екран, видећете неколико микроорганизама који се налазе на различитим местима на игралишту. Морате одабрати један од њих и кликнути на њега мишем. На овај начин убризгавате лек и бактерију експлодирате. Њени комади који падају у друге микроорганизме ће их уништити и за то ћете добити бодове.
