У далекој галаксији избио је рат између две ванземаљске расе. Ви се у игри Цласх Оф Алиенс придружите једном од њих и командат ћете војском. Ваша флота ће ући у битку против ескадрила непријатељских бродова. На екрану ћете видети свој главни брод испред себе. Испод ње ће се налазити контролна табла. Помоћу њега послаћете своје пилоте у битку на њиховим бродовима. Нападају непријатеља уништиће их и за то ће вам дати бодове.
