Млади пилот Том добио је наређење од своје команде да се инфилтрира у непријатељску свемирску станицу. Да би слетио на њега, мораће да користи свој свемирски брод. Ви у игри Кс-Тренцх Рун мораћете да помогнете нашем јунаку да заврши ове акције. На свом броду ћете летјети дуж свемирске базе. На путу ћете наићи на разне препреке и замке. Приликом обављања маневара у свемиру на свом свемирском броду, мораћете да избегнете судар са овим препрекама.
