У древној Јапанији постојао је Орден ниња ратника који су се борили против различитих непријатеља државе и чудовишта. Данас смо у игри Ниња Дефендер помоћићемо једном рату да уђе у храм и испуни задатак главног његовог налога. Наш јунак који путује кроз храм продиреће у његове сале. Нападат ће га разни чудовишта. Наш лик ће врло пуно користити оружје као бумеранг. Убацивши га у непријатеља, ударацемо га, а онда ће објекат вратити назад. Мораћемо да померимо карактер тако да га одбија и тиме поново баца бацач. Ако немамо времена за то, ми ћемо изгубити оружје и изгубити рунду.
