Постоји велики број људи, међу њима еминентни научници који верују да су ванземаљци већ дуго дошли на земљу, живе међу земљанима и утичу на њихове животе. У игри Цловнс Вс Алиенс можете спречити такав сценарио хватања планете и помоћи вам кловнова, коју води капетан Паиси. Он је саставио оригинални арсенал да уништи ванземаљце и позива вас да га користите за одбрану. Оружје се налази на левом вертикалном панелу. За почетак ће вам бити доступни само црни балони. Они ће се лако бавити првим таласима напада. Следеће нам треба оружје. Приступ њима ће се отворити када је скала изнад куглица пуна.
